Su valor es sobrevaluado, teniendo razones ecológicas las Islas del Cisne albergan a una excepcional biodiversidad, sirviendo como hábitats críticos para especies endémicas, migratorias y en peligro de extinción. La protección de estas islas ayudará a preservar recursos genéticos únicos y a mantener el equilibrio ecológico dentro del Sistema Arrecifal Mesoamericano y el gran Caribe.
Cuenta con ecosistemas únicos en todo el país, cautiva a diversos turistas entre sus manglares, pastos marinos, parches de bosque húmedo, asimismo, la isla brinda hábitat hacia diversas especies claves tales como la tortuga marina, tiburones, cetáceos y aves marinas. Estas especies juegan un papel crucial en el mantenimiento de la salud y la estabilidad de los ecosistemas marinos y terrestres.
En cuanto a la regulación climática sus ecosistemas terrestres y marinos participan diariamente secuestrando el dióxido de carbono de la atmósfera, estabilizando el clima global, y a su vez brindando protección contra tormentas tropicales y erosión costera.
Tiene un peso social elevado debido a la historia que la Isla del Cisne le aporta al Caribe su exquisito pasado que hace recordar a los bucaneros, piratas, familias caribeñas y grandes potencias extranjeras, un aporte invaluable en cuanto a la educación y conciencia en la biodiversidad, diversas investigaciones científicas y la contribución con la conservación de archipiélagos, recursos terrestres y marinos, no obstante se forja la conciencia sobre la conservación de la naturaleza, fomentar la buena administración ambiental e inspirar a las generaciones futuras a proteger su herencia natural.
Sin duda la economía es un factor importante se podría albergar en ella recursos que son desconocidos, como plantas medicinales, compuestos únicos siendo posible que estos alcanzarán un valor comercial e influir en el desarrollo farmacéutico en el país, la pesca proporciona pargos, meros, jureles y langostas, las cuales sirven de apoyo a los medios de vida y las oportunidades económicas de las comunidades costeras del país, de Centroamérica y el gran Caribe.
